1、在播种和定植前7-10天，每立方米空间用硫磺4克、锯末8克混匀，放在器皿内燃烧，一般在晚上进行，密闭烟熏24小时。也可按每立方米用百分之25百菌清1克、锯末8克混匀，点燃熏蒸。
2、耕松耕层土壤，覆盖地膜，在晴天闭棚升温，使土温达到60℃以上，连续进行2-3天。为提高灭菌效果还可以在暴晒前在土壤中施药。
3、将土壤翻耕、耙平，然后往棚内灌水，使大棚土壤中的病菌、细菌处于无繁殖条件状态，杀死镰刀菌、子囊菌等病菌。
4、温室大棚骨架和辅助设施可用百分这1-2的福尔马林溶液均匀喷洒或洗刷后密闭消毒。
5、土壤消毒以土壤传播侵染的病害有黄萎病、青枯病、枯萎病。防治这些病害，可在定植前半个月，沿畦沟浇福尔马林100—200倍液;然后用薄膜覆盖并密闭5天。一星期后在药剂全部挥发后方可定植。也可百分之50用多菌灵、百分之50甲基托不津300倍液浇洒土壤。